আগরতলা ষড়যন্ত্র মামলা ছিল পাকিস্তান সরকারের দায়ের করা একটি মিথ্যা ও রাজনৈতিক উদ্দেশ্যপ্রণোদিত মামলা, যা দায়ের করা হয় ১৯৬৮ সালে। এই মামলায় শেখ মুজিবুর রহমানসহ তৎকালীন পূর্ব পাকিস্তানের ৩৫ জন বাঙালি রাজনৈতিক নেতা, সরকারি কর্মকর্তা ও সামরিক কর্মকর্তাকে অভিযুক্ত করা হয়। অভিযোগ ছিল যে তারা ভারতের আগরতলায় বসে পাকিস্তান থেকে পূর্ব পাকিস্তানকে বিচ্ছিন্ন করে স্বাধীন বাংলাদেশ প্রতিষ্ঠার ষড়যন্ত্র করছে।
এই মামলার উদ্দেশ্য ছিল বাঙালির স্বাধীনতার আন্দোলন দমন করা এবং শেখ মুজিবুর রহমানের ক্রমবর্ধমান জনপ্রিয়তাকে থামানো। কিন্তু মামলাটি উল্টো পূর্ব পাকিস্তানে গণআন্দোলনের আগুন জ্বালিয়ে দেয়। ১৯৬৯ সালের গণঅভ্যুত্থানের মাধ্যমে ব্যাপক জনচাপে পাকিস্তান সরকার মামলা প্রত্যাহার করতে বাধ্য হয় এবং শেখ মুজিবসহ সকল আসামিকে মুক্তি দেওয়া হয়।
